全能神教會與基督教的教會一樣，都是因着神道成肉身的作工而産生的。基督教的教會是因着道成肉身的主耶穌的顯現作工而産生的，全能神教會是因着末世道成肉身的全能神的顯現作工而産生的，所以歷世歷代的教會都是因着神道成肉身的顯現作工而産生的。神每一步道成肉身的作工都發表很多真理，都有許多人因着神所發表的真理而接受神、跟隨神，這樣，教會就因此産生了。由此可見，教會是由接受神作工、跟隨神的人組成的，這些神選民的集合就稱之為教會。兩千年前，道成肉身的主耶穌顯現作工，傳「天國近了，你們應當悔改！」（馬太福音4:17）的道，作了救贖工作，發表了恩典時代人該實行進入的真理，有許多人都信主跟隨了主，就産生了當時的基督教教會。後來，主耶穌的福音傳到各國各方，直到末世傳遍地極，世界各國基督教的教會都因此而産生，這就是恩典時代的教會。末世，道成肉身的全能神顯現作工在中國大陸，在恩典時代主耶穌救贖工作的基礎上，作了聖經中預言的「審判要從神的家起首」（彼得前書4:17）的工作，向人類打開了神六千年經營計劃的所有奥秘，發表了潔净、拯救人類的一切真理。因着末世全能神的顯現作工，宗教界各宗各派有許多信主多年的人終于聽見了神的聲音，看見主耶穌已經回來了，作了末世審判的工作，他們都印證全能神就是主耶穌的再來，因此都接受了全能神的末世作工，歸回到全能神面前，全能神教會也隨之産生、建立。所以説，全能神教會完全是因着全能神的顯現作工而産生的，是全能神親自設立的，并不是哪一個人設立的。在中國大陸至少有幾百萬人接受、跟隨了全能神，全能神教會的每一個基督徒都認定全能神就是主耶穌的再來，就是末後的基督，是神的顯現。全能神教會的基督徒禱告的是全能神的名，讀的、聽的、交通的都是全能神的話，持守的是全能神所發表的一切真理，這些真理就是神末世帶來的永遠的生命之道。末世神道成肉身作工，親自設立、見證神所使用的人來配合神的作工，就像主耶穌作工時親自選用、設立十二使徒一樣，但這些被神使用的人只是配合神的作工，不能代替神作工，教會不是神使用的人設立的，神選民信的、跟隨的也不是神所使用的人。就如恩典時代的教會不是彼得、保羅等使徒設立的，而是因着主耶穌的作工産生的，是主耶穌親自設立的。同樣，末世全能神教會也不是神所使用的人設立的，而是因着全能神的作工産生的，是全能神親自設立、親自牧養的。神所使用的人只是澆灌、供應、帶領衆教會，是盡人的本分，神的選民雖然有神使用的人帶領、澆灌、供應，但神選民信的是全能神，跟隨的也是全能神，這是任何人都無法否認的事實。全能神教會的多數人都是從基督教、天主教等各宗各派裏信主多年的人中轉過來的，他們都明白聖經，接受全能神的末世作工後就在各宗各派中見證主耶穌已經回來了，就是全能神，發表真理作了末世審判的工作。有許多人因着看見了全能神的話都是真理，正是神的聲音，就都接受了全能神，這些人就是第一批被提到神寶座前的人。現在，全能神的話語已經公布在網上面向世界，各種見證神末世作工的影視作品也越來越多，各國各方越來越多的人都在尋求考察後接受了全能神的末世作工，這就應驗了聖經中的預言「萬民都要流歸這山」（以賽亞書2:2），最終所有真心信神的人都要歸向全能神，這是大勢所趨，因為這是神早已計劃好的，是神的命定，無人能改變得了！正如全能神説：「我民必聽我音，凡是真心愛我的人必會回歸我的寶座之前的！」《話・卷一　神的顯現與作工・神向全宇的説話・第一篇》